人類泛基因組首個草圖發(fā)布
來源：科技日報 發(fā)布時間：2023-05-11 14:25:37
科技日報北京5月10日電 （記者張夢然）《自然》雜志發(fā)表了人類泛基因組參考的“初稿”，這一集合旨在最終代表人類這一物種中盡可能多的DNA序列。該研究為人類基因組提供了更為完整的圖像。自2001年發(fā)布草案以來，人類參考基因組一直是人類基因組的支柱。但由于結(jié)構(gòu)變異和替代等位基因的存在，有些單個基因組無法代表人類物種的遺傳多樣性。
此次在論文的合集中，“人類泛基因組參考聯(lián)盟”提出了首個人類泛基因組參考草圖，以及兩個使用這一參考為基礎進行新遺傳學研究的發(fā)現(xiàn)。泛基因組開發(fā)自47名祖先不同個體的陣列，為當下的參考人類基因組（GRCh38）添加了1.19億堿基對和1115個基因重復（一個DNA區(qū)域里含有一個基因重復的變異）。利用這一草圖，檢測到結(jié)構(gòu)變異的數(shù)量增加了104%，為人類基因組遺傳多樣性提供了更完整的圖景。
兩篇同時發(fā)表的文章提出了使用人類泛基因組草圖的相關(guān)發(fā)現(xiàn)。其中，美國華盛頓大學醫(yī)學院開發(fā)了一個有片段重復序列（在基因組一個以上位點重復出現(xiàn)、共享高度相同序列的DNA區(qū)域）的單核苷酸變異（SNV）圖譜，描述了數(shù)百萬此前未繪制的SNV和與單一DNA不同的變異性質(zhì)。田納西大學衛(wèi)生與人文科學學院則觀察了異源著絲粒染色體短臂（中節(jié)位于靠近染色體一端）間的重組模式，為一種染色體之間的DNA交換機制提供了證據(jù)（這種機制過去曾推測存在，但因缺乏合適數(shù)據(jù)未觀測到）。
這些成果還只是人類泛基因組前景中的一個過渡階段，該計劃旨在獲取350名遺傳多樣性個體數(shù)據(jù)。同時發(fā)表的觀點文章提出，還需克服一些現(xiàn)有的挑戰(zhàn)，如要更多樣化地取樣，而這最終將為更多人的健康帶來益處。
人類基因組含有約31億個DNA堿基對，從總體上來看，人類基因組非常相似，但DNA序列的微小差異，也使得每個個體各不相同。人類泛基因組參考聯(lián)盟（HPRC）旨在創(chuàng)建一個更為精準和完整的人類參考基因組，反映世界人口的多樣性。去年，HPRC在《自然》上闡釋了泛基因組計劃的目標和戰(zhàn)略，今年，《自然》發(fā)表了首個人類泛基因組參考草圖以及由此獲得的研究成果。計劃還要繼續(xù)推進，最終要創(chuàng)建完整的人類基因組參考序列，擁抱遺傳學的未來。
責任編輯：邢敏
